More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0142 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  100 
 
 		 310 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  97.42 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  97.1 
 
 		 310 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  87.42 
 
 		 310 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  80 
 
 		 310 aa  508  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  56.51 
 
 		 305 aa  336  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  59.22 
 
 		 302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  58.65 
 
 		 305 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  57.14 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  56.96 
 
 		 312 aa  333  3e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  52.7 
 
 		 510 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  54.92 
 
 		 305 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  53.23 
 
 		 513 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  53.48 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  53.48 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  52.53 
 
 		 511 aa  326  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  52.7 
 
 		 516 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  56.51 
 
 		 305 aa  321  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  55.13 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  51.6 
 
 		 512 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  51.76 
 
 		 507 aa  318  7.999999999999999e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  49.69 
 
 		 537 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  51.44 
 
 		 531 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  52.88 
 
 		 511 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  50.8 
 
 		 533 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  50.48 
 
 		 560 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  48.77 
 
 		 575 aa  313  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  55.87 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  51.6 
 
 		 507 aa  313  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  51.61 
 
 		 509 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  50.16 
 
 		 512 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  51.61 
 
 		 509 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  51.28 
 
 		 516 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  50.96 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  48.46 
 
 		 528 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  48.77 
 
 		 575 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  50.48 
 
 		 560 aa  310  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  49.84 
 
 		 509 aa  310  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  50.64 
 
 		 517 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  48.15 
 
 		 528 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  47.84 
 
 		 528 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  49.07 
 
 		 528 aa  309  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  51.92 
 
 		 516 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  50.48 
 
 		 512 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  50.97 
 
 		 509 aa  308  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  56.73 
 
 		 305 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  49.84 
 
 		 512 aa  308  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  50.48 
 
 		 510 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  47.53 
 
 		 548 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  47.84 
 
 		 528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  51.89 
 
 		 527 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  49.84 
 
 		 515 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  47.22 
 
 		 528 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  49.35 
 
 		 517 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  52.04 
 
 		 526 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  47.84 
 
 		 542 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  51.1 
 
 		 520 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  47.84 
 
 		 542 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  51.26 
 
 		 534 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  49.84 
 
 		 512 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  49.84 
 
 		 515 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  49.84 
 
 		 515 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  47.22 
 
 		 528 aa  305  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  49.84 
 
 		 512 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  49.84 
 
 		 512 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  49.84 
 
 		 512 aa  305  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  49.52 
 
 		 512 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  49.84 
 
 		 515 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  49.37 
 
 		 512 aa  305  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  52.88 
 
 		 304 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  54.29 
 
 		 305 aa  305  9.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  52.08 
 
 		 523 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  50.47 
 
 		 528 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  51.76 
 
 		 519 aa  304  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  47.22 
 
 		 542 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  46.6 
 
 		 528 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  50 
 
 		 516 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  48.11 
 
 		 525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  52.4 
 
 		 510 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  51.58 
 
 		 517 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  46.3 
 
 		 528 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  50.31 
 
 		 556 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  47.8 
 
 		 525 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  49.36 
 
 		 525 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  47.63 
 
 		 522 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  50.62 
 
 		 527 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  47.22 
 
 		 540 aa  301  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  49.37 
 
 		 511 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  48.43 
 
 		 525 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  48.43 
 
 		 525 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  48.11 
 
 		 525 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  49.36 
 
 		 525 aa  301  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  48.11 
 
 		 525 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  48.11 
 
 		 525 aa  301  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  47.8 
 
 		 525 aa  301  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  49.35 
 
 		 513 aa  301  9e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  48.72 
 
 		 518 aa  301  9e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  49.84 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  48.11 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  48.11 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>