More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0734 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  68.55 
 
 
957 aa  1263    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  80.65 
 
 
919 aa  1454    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  81.49 
 
 
919 aa  1478    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
920 aa  1838    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
660 aa  396  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
675 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
695 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
713 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
701 aa  389  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
673 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
696 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
658 aa  382  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
679 aa  379  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
666 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.6 
 
 
677 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  40.9 
 
 
673 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
655 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
681 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  38.81 
 
 
660 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
691 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
666 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
697 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  39.77 
 
 
667 aa  363  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  39.77 
 
 
667 aa  363  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  39.77 
 
 
667 aa  362  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
656 aa  360  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  46.02 
 
 
774 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  46.45 
 
 
1089 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  38.59 
 
 
670 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  37.92 
 
 
670 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  45.29 
 
 
769 aa  357  5e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 
1031 aa  357  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  44.17 
 
 
769 aa  357  5.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  38.16 
 
 
685 aa  357  6.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  44.96 
 
 
770 aa  356  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  45.29 
 
 
783 aa  355  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  45.9 
 
 
770 aa  355  2e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
598 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  45.29 
 
 
769 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
671 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
709 aa  354  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
657 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  39.14 
 
 
692 aa  353  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
653 aa  353  8.999999999999999e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
671 aa  350  7e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  38.19 
 
 
672 aa  348  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
770 aa  348  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  39.01 
 
 
667 aa  347  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  45.08 
 
 
785 aa  347  7e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
715 aa  346  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
954 aa  344  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  34.26 
 
 
1010 aa  344  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
1030 aa  344  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
674 aa  342  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
650 aa  340  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  44.62 
 
 
610 aa  340  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
606 aa  340  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 
603 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  44.44 
 
 
598 aa  338  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
604 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  44.39 
 
 
601 aa  337  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
607 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
614 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  43.5 
 
 
552 aa  335  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  43.5 
 
 
552 aa  335  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.2 
 
 
767 aa  335  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  43.22 
 
 
803 aa  334  5e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  40.33 
 
 
897 aa  334  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
747 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  37.38 
 
 
702 aa  332  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
743 aa  332  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  43.04 
 
 
744 aa  332  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
691 aa  330  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  41.56 
 
 
754 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  42.53 
 
 
744 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
719 aa  329  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1543  two component signalling adaptor domain-containing protein  40.6 
 
 
468 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.322642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  42.19 
 
 
748 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
747 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
745 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  42.74 
 
 
785 aa  328  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.78 
 
 
754 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
664 aa  327  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  42.41 
 
 
753 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
739 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
759 aa  326  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  41.84 
 
 
758 aa  326  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
741 aa  325  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
747 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
741 aa  325  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
737 aa  324  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
747 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
746 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
738 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  42.97 
 
 
714 aa  324  6e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  37.98 
 
 
751 aa  324  6e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  41.32 
 
 
760 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.68 
 
 
806 aa  323  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
746 aa  323  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>