115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2204 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  100 
 
 		 628 aa  1222    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  37.07 
 
 		 631 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  33.98 
 
 		 629 aa  289  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  37.43 
 
 		 602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  38.59 
 
 		 603 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  37.69 
 
 		 604 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  37.9 
 
 		 604 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 604 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  35.68 
 
 		 605 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  35.15 
 
 		 605 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  37.79 
 
 		 605 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  37.04 
 
 		 604 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  37.32 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  38 
 
 		 635 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  38.66 
 
 		 607 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  31.24 
 
 		 603 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  32.18 
 
 		 603 aa  223  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  32.24 
 
 		 625 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  29.42 
 
 		 661 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  33.24 
 
 		 394 aa  211  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  33.24 
 
 		 396 aa  211  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 595 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  30.41 
 
 		 617 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  30.65 
 
 		 596 aa  180  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 653 aa  177  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 619 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  27.71 
 
 		 616 aa  171  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  25.67 
 
 		 626 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  27.79 
 
 		 628 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  27.64 
 
 		 627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  25.91 
 
 		 555 aa  165  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  31.64 
 
 		 621 aa  163  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  27.44 
 
 		 627 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  26.15 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  24.19 
 
 		 603 aa  163  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  26.41 
 
 		 658 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  27.44 
 
 		 634 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  27.24 
 
 		 634 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  27.24 
 
 		 634 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  27.44 
 
 		 634 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  25.71 
 
 		 624 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  30.45 
 
 		 705 aa  154  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  27.56 
 
 		 607 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  25.95 
 
 		 634 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  27.44 
 
 		 603 aa  153  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  31.95 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  26.51 
 
 		 677 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  26 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  28.33 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  24.45 
 
 		 617 aa  133  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  23.21 
 
 		 604 aa  125  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  23.71 
 
 		 672 aa  124  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  27.44 
 
 		 576 aa  117  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  24.75 
 
 		 666 aa  117  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  23.3 
 
 		 672 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  33.76 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  34.39 
 
 		 576 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  28.2 
 
 		 721 aa  107  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  23.8 
 
 		 689 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  23.8 
 
 		 689 aa  106  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  23.65 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  28.66 
 
 		 678 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  28.35 
 
 		 678 aa  104  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  28.35 
 
 		 678 aa  104  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  28.35 
 
 		 678 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 678 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 678 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 678 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  28.35 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  23.09 
 
 		 674 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  28.13 
 
 		 704 aa  91.3  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  23.16 
 
 		 680 aa  90.9  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  25.79 
 
 		 612 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  25.79 
 
 		 612 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  26.71 
 
 		 680 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  26.71 
 
 		 680 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  26.71 
 
 		 680 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  24.16 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  26.71 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  26.71 
 
 		 680 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  25.6 
 
 		 682 aa  82  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.82 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  33.71 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  31.18 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.2 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  30.11 
 
 		 407 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0183  hypothetical protein  30.14 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  22.72 
 
 		 643 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0422  extracellular ligand-binding receptor  30.94 
 
 		 399 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 		 403 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1484  hypothetical protein  23.4 
 
 		 481 aa  51.2  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0398  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 		 399 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 375 aa  51.2  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0302  hypothetical protein  23.61 
 
 		 705 aa  50.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0292766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>