122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1369 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 418 aa  872    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  62.11 
 
 		 418 aa  553  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  62.59 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 418 aa  532  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  59.46 
 
 		 422 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 473 aa  352  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 540 aa  326  6e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 537 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 542 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  45.22 
 
 		 570 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 361 aa  186  9e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 358 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 357 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.93 
 
 		 377 aa  143  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  26 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 386 aa  97.1  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  24.35 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.83 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  27 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  19.82 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  33.33 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.07 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.64 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.95 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.01 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.58 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.8 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.4 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.06 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.86 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 326 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 327 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 325 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 323 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.8 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.04 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.58 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.22 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.58 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 329 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.56 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 331 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.47 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.99 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 323 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 323 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.68 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.68 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  29.77 
 
 		 641 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>