More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5018 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  93.99 
 
 
283 aa  510  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  87.28 
 
 
282 aa  481  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4930  luciferase-like protein  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  37.55 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  37.55 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  37.55 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  35.76 
 
 
274 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  36.75 
 
 
274 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  36.71 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  37.26 
 
 
301 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  34.63 
 
 
278 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  36.88 
 
 
282 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  37.67 
 
 
292 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  37.26 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  34.86 
 
 
275 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  36.43 
 
 
287 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  36.12 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.5 
 
 
277 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34.8 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  33.84 
 
 
291 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  32.57 
 
 
275 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2903  putative F420-dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.795057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  32.44 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  33.94 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  32.66 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  30.53 
 
 
281 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  33.61 
 
 
284 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  33.61 
 
 
289 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  29.65 
 
 
337 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.27 
 
 
294 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  30.37 
 
 
335 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  33.88 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  27.44 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  31.96 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  31.96 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  31.96 
 
 
308 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.93 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  35 
 
 
283 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  35 
 
 
283 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  31.86 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  36.02 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  34.44 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  34.05 
 
 
339 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.2 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.25 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  30.27 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  31.84 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  33.9 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  31.84 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
362 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  31.84 
 
 
351 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  29.91 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  32.6 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.27 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.19 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.58 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  28.33 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  25.86 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.21 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  35.17 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  30 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  25.78 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  28.12 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  32.2 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  28.33 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.73 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  27.8 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  30 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  30 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  30 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  26.16 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.81 
 
 
296 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.19 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.07 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  34.55 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  29.17 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.02 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  28.07 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  29.03 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  30.08 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  32.78 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  28.8 
 
 
360 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  29.14 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  29.14 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  29.14 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  30 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  30.4 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  29.14 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.8 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  34.15 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>