90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5558 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  100 
 
 
243 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  99.59 
 
 
243 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  99.59 
 
 
243 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  35.27 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  37.17 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  38.33 
 
 
234 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  38.33 
 
 
234 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  38.33 
 
 
234 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  37.9 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  38.87 
 
 
250 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  37.79 
 
 
251 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  34.69 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  40.57 
 
 
244 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  41.44 
 
 
248 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  38.8 
 
 
251 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  38.93 
 
 
232 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  37.92 
 
 
240 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  40.57 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  37.9 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  33.55 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  37.22 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.62 
 
 
425 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  36.62 
 
 
425 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  26.46 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  31.39 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  26.92 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  26.51 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  26.92 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  28.38 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  33.62 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  32.24 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  30.9 
 
 
300 aa  62  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  27.47 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  29.77 
 
 
309 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.31 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  29.41 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  28.76 
 
 
304 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  22.94 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.42 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  30.81 
 
 
265 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  29.96 
 
 
270 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.39 
 
 
300 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  29.15 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  38.33 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  29.91 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  25.78 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  29.52 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  31.94 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  31.94 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  31.19 
 
 
244 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  28.98 
 
 
265 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  28.85 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  27.07 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  32.54 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  29.38 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  28.91 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  25 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  28.91 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  26.91 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  25.47 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  28.44 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  29.95 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  28.21 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  26.29 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  26.42 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  26.32 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  30.61 
 
 
278 aa  48.9  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  29.27 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  26.01 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  28.03 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  31.36 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  26.79 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  27.39 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  29.56 
 
 
271 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  28.77 
 
 
277 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  32.5 
 
 
259 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  29.73 
 
 
276 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  25.11 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  28.25 
 
 
300 aa  45.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  25.16 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.14 
 
 
271 aa  45.4  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  24.43 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.67 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  31.03 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  31.51 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  28 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  32.65 
 
 
310 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  27.82 
 
 
310 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  24.04 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  27.94 
 
 
259 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>