More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5247 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5247  ferredoxin  100 
 
 
366 aa  736    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2269  ferredoxin  82.68 
 
 
360 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2316  ferredoxin  82.68 
 
 
360 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2308  ferredoxin  78.63 
 
 
247 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0252  ferredoxin  45.04 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  42.3 
 
 
379 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  42.44 
 
 
376 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  44.41 
 
 
368 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  42.15 
 
 
376 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  42.15 
 
 
376 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4133  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.77 
 
 
370 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  41.03 
 
 
380 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.1 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  41.31 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.25 
 
 
363 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.34 
 
 
371 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1087  ferredoxin  40.95 
 
 
381 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  41.57 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  43.94 
 
 
760 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.19 
 
 
367 aa  272  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5060  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.6 
 
 
366 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23260  flavodoxin reductase family protein  41.46 
 
 
375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.405021  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  44.38 
 
 
363 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.75 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.1 
 
 
374 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4481  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.34 
 
 
384 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  38.66 
 
 
350 aa  229  4e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.51 
 
 
376 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.76 
 
 
368 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1258  oxidoreductase FAD-binding region  35.51 
 
 
355 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1275  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.51 
 
 
355 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382937  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1284  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.23 
 
 
355 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.487171  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1577  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
382 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
346 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4815  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.78 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.02 
 
 
380 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.4 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.02 
 
 
380 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2286  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.09 
 
 
369 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03879  oxidoreductase  30.59 
 
 
358 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.938155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0668  ferredoxin  31.16 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0416627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  32.3 
 
 
325 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.98 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0360  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.03 
 
 
350 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  32.33 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  33.65 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.39 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  32.7 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.37 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.39 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  29.26 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.39 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.39 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.75 
 
 
382 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.7 
 
 
380 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  30.75 
 
 
382 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.75 
 
 
382 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.48 
 
 
371 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.57 
 
 
388 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.68 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5611  putative oxidoreductase  29.86 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.43 
 
 
382 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.27 
 
 
375 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.43 
 
 
382 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  31.68 
 
 
356 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64620  putative oxidoreductase  29.94 
 
 
366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407682  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.03 
 
 
382 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.25 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  29.93 
 
 
662 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.84 
 
 
386 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30.22 
 
 
382 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  33.45 
 
 
379 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  29.78 
 
 
355 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.33 
 
 
407 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  28.78 
 
 
358 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.88 
 
 
375 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.78 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  25.86 
 
 
355 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  26.55 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.86 
 
 
374 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.21 
 
 
403 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  29.56 
 
 
366 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  30.63 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.4 
 
 
375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.97 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  29.06 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  28.38 
 
 
605 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  29.06 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.62 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.16 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.39 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.21 
 
 
396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  28.66 
 
 
366 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.08 
 
 
381 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  27.83 
 
 
364 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  29.91 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.64 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  27.81 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.67 
 
 
368 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.61 
 
 
414 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>