41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2429 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  85.12 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  66.37 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  66.37 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  66.37 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  61.9 
 
 
260 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  34.25 
 
 
372 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  36.04 
 
 
382 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  28.45 
 
 
398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  30.06 
 
 
345 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
378 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
378 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  32.53 
 
 
378 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  30.47 
 
 
360 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  27.54 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  30.7 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  29.76 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  27.38 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  28.08 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2096  hypothetical protein  45.12 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  27.67 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  27.86 
 
 
359 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  28.95 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
667 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  29.2 
 
 
667 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  29.2 
 
 
667 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  31.12 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  27.68 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  26.64 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  27.31 
 
 
678 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  28.41 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  25.94 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  29.55 
 
 
661 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2246  hypothetical protein  34.07 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2933  hypothetical protein  28.18 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17900  predicted aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.215694  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  43.64 
 
 
561 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  28.17 
 
 
445 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>