More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0948 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0948  survival protein SurE  100 
 
 
261 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4943  Survival protein SurE  47.98 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000261031  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3494  Survival protein SurE  47.76 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2766  Survival protein SurE  46.64 
 
 
257 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35 
 
 
250 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  34.9 
 
 
253 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 
253 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  34.31 
 
 
254 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  34.31 
 
 
254 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 
258 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  34.31 
 
 
254 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.23 
 
 
258 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3078  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  33.59 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  34.96 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  34.63 
 
 
255 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  33.61 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  35.18 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  32.92 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  34.57 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  32.51 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  34.63 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  37.99 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  34.09 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  36.87 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  35.15 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  32.49 
 
 
250 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  29.32 
 
 
281 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  29.32 
 
 
281 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  35.87 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  32.5 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  37.19 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  34.95 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  32.4 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  34.78 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  37.16 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  32.12 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0285  5'-nucleotidase / exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase  29.67 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.443124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  30.77 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  36.02 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  33.21 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  32.31 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  32.92 
 
 
259 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 
262 aa  89  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 
262 aa  89  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  32.83 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  32.83 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  32.83 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  36.21 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.32 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  28.88 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0491  stationary phase survival protein SurE  34.72 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0551134  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  32.77 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  33.51 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  34.76 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  34.76 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  35.87 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  31.67 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  35.96 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  34.76 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  32.09 
 
 
249 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1257  stationary-phase survival protein SurE  32.46 
 
 
251 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.188641  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  32.26 
 
 
269 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  38.54 
 
 
250 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  38.54 
 
 
250 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
249 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  33.51 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  34.41 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  35.98 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  32.62 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  33.7 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  34.39 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 
247 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  35.11 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  32.99 
 
 
262 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  30.92 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  34.3 
 
 
253 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  29.9 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  32.8 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>