More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2071 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  100 
 
 
564 aa  1167    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  47.71 
 
 
564 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  44.61 
 
 
583 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  44.38 
 
 
579 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  43.96 
 
 
563 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  42 
 
 
614 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  41.32 
 
 
564 aa  445  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  38.08 
 
 
575 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  39.7 
 
 
546 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2252  TrkA-N domain protein  39.25 
 
 
607 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000542956  normal  0.119281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  33.69 
 
 
562 aa  342  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  31.91 
 
 
650 aa  298  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  29.58 
 
 
333 aa  97.4  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
371 aa  95.9  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.27 
 
 
351 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 
350 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 
350 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 
350 aa  91.3  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.44 
 
 
347 aa  90.5  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  25.31 
 
 
351 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  24.82 
 
 
332 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 
346 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.05 
 
 
338 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  25.78 
 
 
331 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  24.68 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.25 
 
 
351 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.25 
 
 
351 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.25 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.91 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 
330 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  24.15 
 
 
350 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.47 
 
 
352 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  28.3 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  23.36 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  27.87 
 
 
335 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  39.6 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.83 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  26.97 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  31.33 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  25.73 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  30.08 
 
 
346 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25.59 
 
 
356 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 
256 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.24 
 
 
336 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.71 
 
 
354 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.59 
 
 
356 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.92 
 
 
352 aa  76.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  28.46 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.38 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.41 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28.51 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  29.9 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.51 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.51 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.51 
 
 
330 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  22.43 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  28.07 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.1 
 
 
395 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.54 
 
 
337 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.21 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  23.33 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.19 
 
 
352 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.48 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 
335 aa  67  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  39.18 
 
 
345 aa  67  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  25.85 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 
335 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  25.23 
 
 
399 aa  65.1  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 
335 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  26.71 
 
 
542 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  24.41 
 
 
346 aa  64.3  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 
568 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 
568 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  23.36 
 
 
332 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.36 
 
 
332 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  26.77 
 
 
252 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  24.29 
 
 
335 aa  62  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.94 
 
 
337 aa  60.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 
388 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  28.57 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 
347 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  28.64 
 
 
417 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  27.74 
 
 
251 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  28.93 
 
 
350 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  27.34 
 
 
682 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  25.36 
 
 
393 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  30.89 
 
 
359 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 
531 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 
548 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  28.18 
 
 
417 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.18 
 
 
417 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.18 
 
 
417 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.18 
 
 
402 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.18 
 
 
417 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.18 
 
 
417 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.18 
 
 
417 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.18 
 
 
402 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>