More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0540 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
337 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  63.47 
 
 
339 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 
327 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  32.09 
 
 
334 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  30.87 
 
 
349 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
352 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 
344 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
338 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
351 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
351 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
338 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
344 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.69 
 
 
342 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
334 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.69 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.69 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.69 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.69 
 
 
342 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
343 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
312 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
312 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  30.16 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  30.16 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  32.69 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  30.16 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  30.16 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  29.84 
 
 
350 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  29.84 
 
 
350 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  29.84 
 
 
350 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  29.84 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  29.84 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  28.75 
 
 
347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  29.84 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  27.18 
 
 
324 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.52 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  29.52 
 
 
350 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  29.52 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
312 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
312 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  28.76 
 
 
312 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
325 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
312 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
312 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  28.76 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  28.48 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
321 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
335 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 
335 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 
335 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 
320 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 
320 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 
320 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 
320 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 
347 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 
345 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 
318 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
341 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 
320 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  26.03 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
328 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 
319 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
318 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  25.54 
 
 
351 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 
349 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  26.43 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
330 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  38.74 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43.82 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  37.86 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  41.28 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>