185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4579 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  85.04 
 
 		 256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  66.8 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  68.42 
 
 		 249 aa  329  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  58.37 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  62.55 
 
 		 258 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  60.73 
 
 		 258 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  58.89 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  47.83 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1178  Ion transport 2  42.04 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  43.32 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3759  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1838  Ion transport 2 domain protein  40.16 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2729  putative ion transport protein  43.37 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236558  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  30.88 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  30.56 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  32.12 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.95 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  25.1 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  29.8 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  24.62 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  24.23 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  25 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  23.13 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  30.37 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  23.6 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  23.51 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  25 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  25.74 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  24.76 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  25.74 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  25.25 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  25.25 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  23.26 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  25.25 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  25.25 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  23.56 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  21.86 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  25.71 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  29.8 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  24.14 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  26.72 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  25 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  25.76 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  25.11 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  25.13 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  22.81 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  22.54 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  22.99 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  24.88 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  24.33 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  24.88 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  24.5 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  24.5 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  25.82 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  26.39 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  24.5 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  22.42 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  21.84 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  26.95 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  23.51 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.35 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  23.48 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  22.93 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  23.9 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  27.22 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  27.44 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  23.13 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  23.13 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  23.13 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  23.26 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  26.64 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  29.73 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  22.76 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  28.65 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  28.57 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  24.9 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  23.65 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  24.19 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  24.54 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  28.5 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30.23 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  24.61 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  23.11 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.62 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  25.77 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  29.23 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  25.28 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  23.33 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  36.36 
 
 		 517 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  25.81 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  24.16 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29.84 
 
 		 325 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  24.57 
 
 		 405 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  26.13 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  24.71 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  31.63 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  31.63 
 
 		 417 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>