30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3137 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  94.01 
 
 		 263 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3334  hypothetical protein  79.03 
 
 		 263 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  54.1 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  51.56 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0436  hypothetical protein  50.19 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00271012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  40.85 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  41.37 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1751  hypothetical protein  39.33 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0641  hypothetical protein  42.26 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  42.32 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3225  hypothetical protein  35.58 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.063082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  34.64 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3866  hypothetical protein  38.26 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1062  hypothetical protein  33.65 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.976574  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4518  hypothetical protein  34.28 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1018  hypothetical protein  49.06 
 
 		 173 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  39.21 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1331  hypothetical protein  44.83 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1753  hypothetical protein  51.11 
 
 		 97 aa  95.5  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2067  hypothetical protein  44.87 
 
 		 108 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.745596  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2596  hypothetical protein  52.38 
 
 		 101 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  53.85 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  55.56 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  51.28 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  51.28 
 
 		 353 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  57.58 
 
 		 346 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0430  hypothetical protein  39.73 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  60.61 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  58.82 
 
 		 337 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>