272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2461 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  89.74 
 
 		 412 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  98.97 
 
 		 412 aa  770    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 390 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  43.9 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 413 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  39.64 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 		 407 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  43.54 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  43.27 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  42.18 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  38.15 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  42.13 
 
 		 411 aa  249  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  39.89 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  45.48 
 
 		 409 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  40.8 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  43.34 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 		 420 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  37.74 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  38 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 		 415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 405 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 423 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 432 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  32.98 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  30.21 
 
 		 407 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 		 406 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  37.39 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  35.83 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 		 460 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  35.59 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  30.4 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  31.31 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 406 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  23.61 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 		 188 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 		 188 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.31 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  30.81 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.68 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.62 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 770 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.69 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.69 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.69 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  20.68 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  29.73 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.03 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.28 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.35 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  27.73 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.69 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.69 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 386 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.73 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  29.46 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  19.75 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.15 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>