More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1867 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  34.42 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.28 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  34.22 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  37.38 
 
 		 287 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  35.05 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  31.88 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  31.19 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  34.95 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  32.26 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  32.41 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  33.83 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  30.14 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  30.3 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  34.18 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  32.85 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  30.05 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  34.78 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  31.13 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  33.74 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  32.24 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  32.24 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  32.24 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  37.08 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  32.39 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  32.91 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 192 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  33.19 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  33.5 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  31.78 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  28.85 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  28.23 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  31.78 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1146  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  34.93 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3478  GntR domain protein  31.94 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.554366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  29.49 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  31.63 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  29.22 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  29.22 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  29.22 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  31.19 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  33.18 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>