279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1797 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  100 
 
 
111 aa  222  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  71.17 
 
 
113 aa  160  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  68.47 
 
 
113 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  67.57 
 
 
113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  66.36 
 
 
110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  58.26 
 
 
144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  57.66 
 
 
118 aa  129  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  56.6 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  56.76 
 
 
133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  63.83 
 
 
154 aa  120  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  52.83 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  57.01 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  57.94 
 
 
142 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  54.31 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  60.19 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  52.38 
 
 
110 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  52.38 
 
 
110 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  54.05 
 
 
115 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  60 
 
 
123 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50.45 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  50.94 
 
 
111 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  50.56 
 
 
114 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  55.17 
 
 
110 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  48.39 
 
 
111 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  48.42 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  50.86 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  48.11 
 
 
105 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  51.14 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  51.76 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  49.53 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  49.53 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  43.22 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  48.28 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  42.57 
 
 
107 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  47.06 
 
 
93 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  42.57 
 
 
107 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  42.57 
 
 
107 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  42.57 
 
 
107 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  42.57 
 
 
107 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  42.57 
 
 
107 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  42.57 
 
 
107 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  41.75 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  47.13 
 
 
110 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  38.24 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  41.84 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  44.09 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  39.81 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  39.81 
 
 
109 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 
119 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  41.67 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  44.19 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  37.23 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  41.51 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  34.82 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  53.33 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1182  preprotein translocase, YajC subunit  43.62 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.714716  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  44.87 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  39.77 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  35.58 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  36.54 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  46.38 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  45.9 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  39.22 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  37.17 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  42.35 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  40.66 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  36.46 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  42.47 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  42.47 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  38.1 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
109 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 
94 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  40.45 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  40.45 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  47.27 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  35.24 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.14 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  41.18 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>