More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2852 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  100 
 
 		 317 aa  614  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  40.94 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.4 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.73 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  39.54 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 		 835 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  38.26 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  41.49 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.43 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.22 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.98 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  39.86 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3462  monosaccharide-transporting ATPase  41.11 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  39.66 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  39.15 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.22 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1213  monosaccharide-transporting ATPase  39.81 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  37.1 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39 
 
 		 348 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  37.28 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  39.54 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.65 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.07 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.46 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5683  Monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.795031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.33 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  38.62 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.99 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.99 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  33.12 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.64 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.64 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.71 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.31 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  39.15 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 		 320 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  39.79 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  37.02 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  36.7 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  37.02 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  33.87 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  33.87 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  38.38 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  33.65 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 342 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  37.46 
 
 		 342 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  37.46 
 
 		 342 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.44 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.82 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  37.04 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.45 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  36.49 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  36.49 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  36.49 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3605  monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  36.49 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>