More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1378 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1378  recombination protein RecR  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324017  normal  0.0221027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  75.37 
 
 		 195 aa  303  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  50.74 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  51.21 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  49.26 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  49.26 
 
 		 198 aa  201  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  48.77 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  49.5 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  51.98 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  48.28 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  48.28 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  47.76 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  46.04 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  47.52 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  47.26 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  46.04 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  48.28 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  46.04 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  46.53 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  48.06 
 
 		 199 aa  188  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  45.59 
 
 		 201 aa  187  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  46.04 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  46.27 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  48.72 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  44.28 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  49 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  48.72 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  48.28 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  49.23 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  48.22 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  45.85 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  47.94 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  48.99 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1574  recombination protein RecR  47.78 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  unclonable  0.000000162046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  43.56 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  47.76 
 
 		 199 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  45.37 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  45.81 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  45.05 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  46.73 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  47.26 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  47.83 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  48.26 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 199 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  45.81 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  50.99 
 
 		 197 aa  177  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  45.77 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1326  recombination protein RecR  46.83 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.787155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  46.15 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  45.85 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  50.52 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  43.5 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  49.2 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  46.04 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  45.73 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  46.19 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  46.7 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  48.26 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  47.18 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  47.18 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  42.5 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  42.5 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1038  recombination protein RecR  49.25 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.413598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  46.52 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  48.04 
 
 		 199 aa  174  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1130  recombination protein RecR  48.76 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  48.97 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  44.78 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  47.26 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  44.66 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  44.85 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  49.74 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  44.61 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  46.57 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.1 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  45.23 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  44.67 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  44.95 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  46.52 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  44.16 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  45.79 
 
 		 182 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  44.72 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1825  recombination protein RecR  44.83 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>