54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1433 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
412 aa  822    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0235  GCN5-related N-acetyltransferase  60 
 
 
160 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2453  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.97 
 
 
603 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0139  GCN5-related N-acetyltransferase  53.62 
 
 
143 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0466925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1609  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 
147 aa  142  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1128  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 
159 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412545  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  29.54 
 
 
285 aa  98.2  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  27.92 
 
 
284 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  26.19 
 
 
282 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  29.64 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  30.28 
 
 
278 aa  60.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.12 
 
 
294 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  32.67 
 
 
281 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  31.28 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.11 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  30.18 
 
 
279 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
290 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  27.41 
 
 
276 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
157 aa  53.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  29.67 
 
 
295 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.64 
 
 
323 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.08 
 
 
300 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.32 
 
 
288 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  28.42 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3656  acetyltransferase, GNAT family  36.56 
 
 
277 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  26.45 
 
 
157 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.34 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.27 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  34.52 
 
 
162 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  37.88 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.21 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.28 
 
 
295 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  25.11 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  37.88 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.64 
 
 
164 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  27.92 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  28 
 
 
147 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  34.95 
 
 
164 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  34.95 
 
 
164 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  34.95 
 
 
164 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  34.95 
 
 
164 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  34.95 
 
 
164 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  34.95 
 
 
164 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3562  acetyltransferase  32.33 
 
 
277 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  26.5 
 
 
294 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3556  acetyltransferase, GNAT family  30.83 
 
 
277 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000567392 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3342  acetyltransferase  30.83 
 
 
277 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  39.71 
 
 
287 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3566  acetyltransferase, GNAT family  31.58 
 
 
277 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.609379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3603  acetyltransferase  30.83 
 
 
277 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  27.06 
 
 
282 aa  43.1  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.24 
 
 
289 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.56 
 
 
147 aa  43.1  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>