More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1226 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1226  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
261 aa  518  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
257 aa  261  8e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1249  phosphomethylpyrimidine kinase  49.01 
 
 
280 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal  0.283151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 
267 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0845  hypothetical protein  41.57 
 
 
266 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.324232  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 
269 aa  202  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  46.06 
 
 
266 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.13 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  43.7 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  45.61 
 
 
271 aa  192  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.96 
 
 
436 aa  191  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.58 
 
 
268 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  49.37 
 
 
266 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.41 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 
449 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  53.81 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
268 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 
270 aa  188  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
270 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
270 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
268 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
270 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  49.77 
 
 
268 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 
270 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  37.35 
 
 
269 aa  185  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 
492 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
272 aa  185  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  42.56 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  42.56 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  42.02 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.76 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  42.23 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  40.76 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  40.76 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  40.76 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  40.76 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  43.31 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
266 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
449 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  38.78 
 
 
270 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  43.39 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  42.92 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
450 aa  179  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  46.35 
 
 
303 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  40.34 
 
 
270 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  46.38 
 
 
275 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.78 
 
 
497 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  45.02 
 
 
444 aa  176  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  41.1 
 
 
264 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  43.75 
 
 
266 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
267 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  44.3 
 
 
263 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  45.92 
 
 
303 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  42.57 
 
 
265 aa  175  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  44.86 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  46.35 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  46.67 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  38.29 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  44.58 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  46.67 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  48.52 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.21 
 
 
452 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.25 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  44.35 
 
 
271 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0914  phosphomethylpyrimidine kinase  36.25 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  44.09 
 
 
266 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  45 
 
 
490 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1127  phosphomethylpyrimidine kinase  47.48 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  40.62 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  39.29 
 
 
267 aa  171  7.999999999999999e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  40.62 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  46.83 
 
 
285 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  39.41 
 
 
260 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0699  phosphomethylpyrimidine kinase  41.08 
 
 
269 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
264 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  44.94 
 
 
266 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  49.35 
 
 
269 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 
266 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  40.16 
 
 
268 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  38.58 
 
 
265 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  40.51 
 
 
263 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  41.41 
 
 
266 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  39.26 
 
 
274 aa  168  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  39.26 
 
 
274 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>