30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2879 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2879  GSCFA domain protein  100 
 
 		 398 aa  804    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2652  GSCFA domain-containing protein  97.68 
 
 		 398 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5486  GSCFA domain protein  55.24 
 
 		 350 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3997  GSCFA  54.47 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.352086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5393  GSCFA domain protein  53.39 
 
 		 353 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.55266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5315  GSCFA domain protein  52.54 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4847  GSCFA domain-containing protein  52.54 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4329  GSCFA domain-containing protein  49.44 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358428  normal  0.369432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2811  hypothetical protein  51.57 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0177875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3120  GSCFA domain-containing protein  50.32 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2481  hypothetical protein  42.77 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0814953  normal  0.0373078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2100  hypothetical protein  45.73 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.533713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2272  hypothetical protein  40.92 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1007  hypothetical protein  40.7 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.188887  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1589  GSCFA domain-containing protein  35.87 
 
 		 590 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3095  hypothetical protein  35.71 
 
 		 594 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0753  hypothetical protein  34.37 
 
 		 575 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.978907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1449  hypothetical protein  32.6 
 
 		 587 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1942  putative GSCFA family protein  32.65 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.562926  hitchhiker  0.0000963078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3706  GSCFA domain protein  29.03 
 
 		 311 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684078  hitchhiker  0.0000000000345812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4935  hypothetical protein  28.94 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0285  hypothetical protein  24.7 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4970  GSCFA domain-containing protein  26.85 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.432309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05130  hypothetical protein  28.48 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2931  GSCFA domain protein  23.44 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2594  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4934  GSCFA domain protein  22.57 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1111  GSCFA domain protein  23.65 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1897  hypothetical protein  19.93 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0064  GSCFA domain protein  23.91 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00472332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>