More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1988 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  553  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  97.77 
 
 
269 aa  510  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  73.88 
 
 
269 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  60.98 
 
 
275 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1026  methyltransferase type 11  43.06 
 
 
270 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 
277 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  37.34 
 
 
277 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  45.81 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1607  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
287 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  35.12 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  37.91 
 
 
274 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  36.4 
 
 
286 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1683  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
287 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.430407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1590  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 
279 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1785  methyltransferase type 11  42.79 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0456688  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  45.41 
 
 
270 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.9 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  42.29 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  42.29 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2776  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
279 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  38.6 
 
 
274 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 
280 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
266 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
274 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2268  methyltransferase type 11  38.28 
 
 
286 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
274 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
282 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1928  methyltransferase type 11  35.6 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  37.44 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  40.14 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2397  Methyltransferase type 11  38.5 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000574494  decreased coverage  0.000150553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  30.49 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1059  methyltransferase type 11  35.32 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 
225 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.97 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  36.02 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.81 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  40.44 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.55 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4060  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197976  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4208  Methyltransferase type 11  37.02 
 
 
271 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  33 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  33.51 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.95 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.52 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.37 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.9 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.91 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.81 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  40.62 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  40.95 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.95 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  34.46 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.83 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  31 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
581 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.44 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.05 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.95 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  37.29 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  34.8 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.57 
 
 
276 aa  72  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
289 aa  72  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2970  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2818  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  30.17 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.8 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.09 
 
 
233 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  40 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  35.54 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.67 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.92 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  33.76 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  28.06 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.84 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>