35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1604 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  55.06 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  47.06 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  42.61 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  40.12 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  35.4 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  34.95 
 
 		 256 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  35.19 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  34.57 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  31.84 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  48.15 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  35.19 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  30.49 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  49.37 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  48.1 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  29.75 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  52.38 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  29.75 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  41.89 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  37.66 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  36.96 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0442309  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0852  Terminase small subunit  24.68 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0613  putative phage terminase, small subunit  29.94 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2568  hypothetical protein  27.62 
 
 		 284 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  48.98 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  48.98 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3906  hypothetical protein  30.07 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  40.79 
 
 		 338 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  30.12 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3746  putative phage terminase, small subunit  27.39 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0046  putative phage terminase, small subunit  27.39 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2240  hypothetical protein  41.07 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  32.43 
 
 		 147 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0552  hypothetical protein  40.98 
 
 		 112 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0175758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>