39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1001 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  758    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  48.77 
 
 
372 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  38.78 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  36.57 
 
 
385 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  37.27 
 
 
386 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  34.33 
 
 
358 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2157  hypothetical protein  49.14 
 
 
121 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  39.15 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  32.49 
 
 
700 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  32.92 
 
 
255 aa  99.4  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  34.23 
 
 
255 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  33.18 
 
 
254 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  33.18 
 
 
254 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  33.91 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  33.91 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  33.18 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  35.76 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  33.18 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  39.35 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  33.89 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  27.56 
 
 
490 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  30.43 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  34.63 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  35.53 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  35.53 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  31.06 
 
 
259 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  30.72 
 
 
259 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  31.2 
 
 
200 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  24 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  28.12 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  24.9 
 
 
296 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  28.93 
 
 
214 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  37.11 
 
 
241 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  28.24 
 
 
219 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  28.65 
 
 
219 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  27.95 
 
 
238 aa  46.2  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  28.83 
 
 
228 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  28.49 
 
 
252 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>