49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0057 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  92.94 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0010  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.76592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0054  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000221727  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  83.58 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000019175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.872291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  83.1 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.411326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.305018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309150  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309125  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309074  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>