12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_R0036 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.872291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  97.65 
 
 
85 bp  153  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  97.65 
 
 
85 bp  153  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  97.65 
 
 
85 bp  153  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  87.1 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  83.56 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  93.75 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  83.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  93.33 
 
 
97 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  86 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>