19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0013 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  88.16 
 
 
85 bp  79.8  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  85.9 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  85.53 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  84.62 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  85.51 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  86.76 
 
 
84 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  84.51 
 
 
85 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  83.33 
 
 
85 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0036  tRNA-Leu  83.56 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.872291  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0031  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  82.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  82.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  82.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  83.87 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>