31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0067 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  97.22 
 
 
85 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  89.19 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  88.24 
 
 
84 bp  81.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  84.71 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  87.3 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  85.51 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  92.68 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0025  tRNA-Leu  87.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.637113  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0059  tRNA-Leu  96.77 
 
 
83 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  96.67 
 
 
84 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  83.78 
 
 
85 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  96.55 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  83.58 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  91.18 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>