17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0020 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  91.23 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0059  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0035  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13880  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0819816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0034  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000888056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0036  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.381254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>