15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0036 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0059  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0055  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00788362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0049  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>