11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0059 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0046  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 83 bp  85.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0020  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.419352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>