20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_R0009 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0036  tRNA-Leu  97.65 
 
 		 85 bp  153  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.872291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  89.06 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1123t  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3157t  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3159t  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0016  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000058475 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  86.54 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  86.27 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0006  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 97 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.16425 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>