24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0046 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  95.24 
 
 
84 bp  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  91.76 
 
 
85 bp  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  89.29 
 
 
84 bp  95.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0016  tRNA-Leu  89.55 
 
 
83 bp  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.454165  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  85.71 
 
 
84 bp  71.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  84.52 
 
 
84 bp  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  84.52 
 
 
83 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  54  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  83.33 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  88.37 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  88.37 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  88.37 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  84.29 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0046  tRNA-Leu  84.29 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  83.87 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>