31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_R0015 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  95.29 
 
 
85 bp  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  91.36 
 
 
85 bp  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  89.41 
 
 
85 bp  97.6  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  88.24 
 
 
88 bp  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  87.65 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  90.16 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  90.16 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  91.23 
 
 
88 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  91.23 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  86.42 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  88.71 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0051  tRNA-Leu  85.19 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0013  tRNA-Leu  85.53 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  85.14 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  84.71 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  83.53 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  90.91 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  94.44 
 
 
84 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0056  tRNA-Leu  82.35 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0010  tRNA-Leu  84.06 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.010804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>