22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0027 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 84 bp  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  91.76 
 
 		 84 bp  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0016  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 83 bp  93.7  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.454165  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.80963  normal  0.240218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>