22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0044 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 84 bp  95.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  86.54 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  86.54 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  86.54 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0002  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>