11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0049 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  93.06 
 
 		 84 bp  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0039  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0002  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>