16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0037 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  96.39 
 
 		 83 bp  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0055  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00788362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>