12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0063 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  85.54 
 
 
83 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  89.13 
 
 
83 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  93.94 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  89.47 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0002  tRNA-Leu  91.18 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>