11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0011 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0055  tRNA-Leu  93.98 
 
 
83 bp  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00788362  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  90.62 
 
 
83 bp  79.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  89.39 
 
 
83 bp  75.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  88.68 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0063  tRNA-Leu  94.44 
 
 
82 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199117  hitchhiker  0.00257733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  93.75 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  85.19 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>