13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0010 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169378  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0018  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.424159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0018  tRNA-OTHER  82.35 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>