29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0006 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  90.59 
 
 
85 bp  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  88.24 
 
 
85 bp  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  87.06 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  85.88 
 
 
85 bp  73.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  86.96 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  86.96 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  83.95 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  88.68 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  83.95 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0018  tRNA-Leu  93.94 
 
 
84 bp  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  87.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  82.43 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  93.33 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0319872  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0042  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0013  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0018  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.023039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>