41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0008 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3071  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1566  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0028  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0795  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1985  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0038  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2627  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2985  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164752  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3037  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00104737  normal  0.145686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0060  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.943942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0026  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23198  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0050  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0163421  hitchhiker  0.00837665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0059  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309150  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309125  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309074  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.411326  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309262  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000019175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.361674  hitchhiker  0.00190717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.31512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>