More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3622 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 426 aa  870    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0108  tryptophan synthase subunit beta  80.05 
 
 		 393 aa  655    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.82 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 		 389 aa  512  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  61.54 
 
 		 394 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 		 389 aa  512  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0855  tryptophan synthase, beta subunit  61.69 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1170  tryptophan synthase subunit beta  63.52 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1272  tryptophan synthase subunit beta  58.73 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 		 389 aa  501  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  60.61 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2817  tryptophan synthase, beta subunit  63.05 
 
 		 423 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0223  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  59.85 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3038  tryptophan synthase subunit beta  59.65 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.25263  normal  0.0776736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  61.38 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  60.46 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  57.18 
 
 		 411 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  59.23 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 		 399 aa  482  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 		 395 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  58.23 
 
 		 403 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0193  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  59.55 
 
 		 412 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  60.31 
 
 		 397 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  57.03 
 
 		 402 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  58.06 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  55.2 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 411 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  58.97 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  60.36 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  55.2 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1790  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  58.46 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  57.87 
 
 		 391 aa  471  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 407 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  57.88 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  54.77 
 
 		 413 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  59.03 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  57.91 
 
 		 404 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  54.52 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  59.8 
 
 		 401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  54.98 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  54.66 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  58.29 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  58.61 
 
 		 409 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  56 
 
 		 410 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  58.78 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  58.19 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0915  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  55.14 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 434 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  58.82 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 434 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2688  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  57.64 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  56.53 
 
 		 403 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  58.57 
 
 		 447 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 405 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>