More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2700 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  100 
 
 
380 aa  794    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  67.11 
 
 
383 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  67.64 
 
 
385 aa  559  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  65.01 
 
 
389 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  64.92 
 
 
387 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  63.25 
 
 
388 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  60.32 
 
 
381 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 
800 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 
411 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  26.2 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.6 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.6 
 
 
431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.6 
 
 
431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  27.13 
 
 
411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.33 
 
 
447 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.98 
 
 
438 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 
444 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.33 
 
 
431 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  26.86 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  26.6 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  26.86 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  25.96 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  26.86 
 
 
411 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  26.33 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.92 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  27.78 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  27.78 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25.69 
 
 
385 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.98 
 
 
414 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  25.69 
 
 
385 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 
385 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
385 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
385 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.69 
 
 
385 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
385 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  25.81 
 
 
408 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.65 
 
 
370 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.7 
 
 
383 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 
414 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  25.81 
 
 
408 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
408 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 
410 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 
410 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
397 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
402 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 
435 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 
431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 
435 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 
435 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 
407 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 
470 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
395 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  21.17 
 
 
428 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.97 
 
 
395 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.97 
 
 
396 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.56 
 
 
396 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 
369 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 
393 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 
381 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.01 
 
 
394 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.41 
 
 
394 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.28 
 
 
394 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.85 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  24.72 
 
 
280 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.28 
 
 
394 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  20.77 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 
450 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
458 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.04 
 
 
457 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 
452 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  26.44 
 
 
473 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  24.58 
 
 
460 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  31.21 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
460 aa  86.7  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 
447 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.17 
 
 
473 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  26.3 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>