More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2605 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 385 aa  794    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  71.8 
 
 		 385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  60.16 
 
 		 382 aa  501  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  60.52 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  60.84 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  59.69 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  58.96 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  58.44 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.53 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  57.85 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.12 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.45 
 
 		 388 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.5 
 
 		 392 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  54.07 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.81 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.79 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.02 
 
 		 391 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.88 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.05 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.52 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.21 
 
 		 388 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  50 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.83 
 
 		 392 aa  408  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  53.49 
 
 		 384 aa  411  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  48.28 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  45.05 
 
 		 392 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  47.01 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  46.32 
 
 		 402 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  46.58 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  45.03 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  46.72 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  45 
 
 		 391 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  46.32 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  46.05 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  45.08 
 
 		 392 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  45.24 
 
 		 386 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  42.67 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  44.65 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  42.26 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  43.86 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  42.78 
 
 		 391 aa  355  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  44.13 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  44.13 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  44.13 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  44.13 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  44.24 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  43.98 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 		 409 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  43.86 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  45.17 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  42.41 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  42.93 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  43.98 
 
 		 397 aa  352  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  43.34 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  43.46 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  43.86 
 
 		 392 aa  352  8e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  43.6 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  44.5 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  43.72 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 		 408 aa  349  5e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  42.93 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  42.56 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  42.56 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  43.44 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  42.15 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  43.19 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  43.31 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  42.15 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  42.15 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  42.15 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  42.15 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  42.15 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  44.16 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  41.62 
 
 		 411 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  42.71 
 
 		 390 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  41.88 
 
 		 412 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  41.88 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  41.88 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  41.62 
 
 		 402 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  41.88 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  41.88 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  42.2 
 
 		 400 aa  341  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  41.88 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  41.88 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  42.67 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  43.08 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  41.1 
 
 		 411 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  41.62 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  41.1 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.88 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  45.55 
 
 		 395 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  43.46 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  42.15 
 
 		 411 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  42.15 
 
 		 411 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  42.15 
 
 		 411 aa  339  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  42.63 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>