251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1886 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  100 
 
 
214 aa  441  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  61.06 
 
 
203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0420  hypothetical protein  60.1 
 
 
199 aa  244  8e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0595779  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1499  FMN-binding protein  62 
 
 
202 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.23332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0361  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.25 
 
 
200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1050  hypothetical protein  45.74 
 
 
191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  32.04 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  32.93 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  35.8 
 
 
209 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  29.47 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  35.37 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  34.15 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  34.15 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  34.15 
 
 
205 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.94 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  35.19 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  33.54 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.44 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  32.52 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  34.57 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  32.52 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  34.15 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  32.72 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  32.12 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  31.71 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  33.95 
 
 
207 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.87 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  31.74 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  32.32 
 
 
208 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  32.32 
 
 
221 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  32.32 
 
 
208 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  33.74 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  29.28 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  32.96 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  30.69 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  32.34 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.32 
 
 
203 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  32.1 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  31.87 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  34.67 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  29.79 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  28.81 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.58 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  30.64 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  37.17 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  28.81 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  31.52 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  33.54 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  31.93 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  32.93 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  32.93 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  32.32 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  31.22 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  31.22 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  32.93 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  32.32 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  33.14 
 
 
203 aa  82  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  34.39 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  34.39 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  32.56 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  32.93 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  29.94 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  32.93 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  32.56 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  32.93 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  28.25 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  32.56 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  32.32 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  29.79 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  29.28 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.32 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  30 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.25 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  32.93 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  31.71 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  32.32 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  32.32 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  31.1 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  27.87 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  32.75 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  29.35 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  33.75 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  31.21 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  31.69 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  32.18 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  31.08 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  28.05 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.22 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  34.17 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  31.1 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  31.98 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  31.98 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  31.98 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  29.34 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  31.1 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  28.73 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  30.54 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>