249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0793 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  67.76 
 
 
321 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  60.47 
 
 
302 aa  360  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  57.52 
 
 
309 aa  347  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  58 
 
 
318 aa  326  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  54.15 
 
 
320 aa  325  7e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  53.09 
 
 
319 aa  317  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  54.97 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  52.01 
 
 
309 aa  293  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  50.66 
 
 
313 aa  287  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  52.48 
 
 
331 aa  261  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  43.67 
 
 
331 aa  236  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  44.41 
 
 
323 aa  236  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  42.81 
 
 
327 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  39.58 
 
 
351 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  47.03 
 
 
319 aa  186  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  40 
 
 
346 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  38.69 
 
 
342 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  39.8 
 
 
346 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  38.46 
 
 
346 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  39 
 
 
346 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  37.46 
 
 
346 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  38.8 
 
 
343 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  38.8 
 
 
343 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.67 
 
 
346 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  36.82 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.93 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.49 
 
 
332 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.13 
 
 
346 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  35.69 
 
 
349 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  35.46 
 
 
344 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.67 
 
 
354 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  39.09 
 
 
349 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  37.67 
 
 
344 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.87 
 
 
378 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  35.64 
 
 
332 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.7 
 
 
369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.09 
 
 
362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  39.03 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  37.26 
 
 
342 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.76 
 
 
347 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  34.71 
 
 
353 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.85 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.21 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.18 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  34.92 
 
 
348 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.75 
 
 
355 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  33.55 
 
 
358 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.78 
 
 
354 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  34.63 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.73 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.04 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.86 
 
 
350 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  37.91 
 
 
355 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.09 
 
 
345 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.09 
 
 
333 aa  132  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  34.11 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.69 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  38.43 
 
 
355 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3335  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.99 
 
 
362 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000368125 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  37.54 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0663  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.24 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.109881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  35.31 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  37.2 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  34.64 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  34.74 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.55 
 
 
350 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.09 
 
 
356 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  35.55 
 
 
350 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.67 
 
 
357 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  37.58 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0945  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  35.78 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.11 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.44 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.64 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.08 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2173  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  35.03 
 
 
366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1773  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  34.33 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.91 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.88 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  35.18 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.17 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  34.31 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  35.97 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  34.31 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  37.13 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  34.31 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  34.21 
 
 
350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  38.91 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  35.74 
 
 
321 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  35.24 
 
 
365 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  38.02 
 
 
339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.08 
 
 
348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.22 
 
 
354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.99 
 
 
348 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.5 
 
 
353 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  36.99 
 
 
321 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.11 
 
 
348 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  34.59 
 
 
358 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  31.74 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>