More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3297 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3297  transport system permease protein  100 
 
 
341 aa  634    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2063  transport system permease protein  59.39 
 
 
339 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2700  transport system permease protein  61.59 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  53.03 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  44.88 
 
 
334 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  41.61 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.32 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  39.23 
 
 
347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  42.81 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4511  transport system permease protein  44.83 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.217437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  42.58 
 
 
350 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  40.3 
 
 
335 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  38.56 
 
 
344 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  44.11 
 
 
353 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  39.69 
 
 
335 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  42.55 
 
 
358 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  37.65 
 
 
347 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  42.31 
 
 
344 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  41.5 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  35.2 
 
 
333 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  39.17 
 
 
348 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  36.51 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  42.56 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  35.46 
 
 
322 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  35.67 
 
 
322 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  36.5 
 
 
350 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  41.23 
 
 
336 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  40.07 
 
 
343 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  37.62 
 
 
337 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  42.81 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  39.75 
 
 
329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.35 
 
 
368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  40.28 
 
 
341 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  35.21 
 
 
334 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  43.39 
 
 
332 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  35.21 
 
 
334 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
334 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  33.01 
 
 
340 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 
334 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  42.53 
 
 
366 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  41.88 
 
 
366 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.75 
 
 
374 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  33.01 
 
 
340 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  32.68 
 
 
334 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  41.1 
 
 
351 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  37.7 
 
 
329 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  32.68 
 
 
340 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.49 
 
 
346 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  32.28 
 
 
343 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  33.23 
 
 
334 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  39.5 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  41.37 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  39.14 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  35.87 
 
 
336 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  36.27 
 
 
334 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  45.1 
 
 
360 aa  165  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  40.85 
 
 
338 aa  165  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  38.46 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  39.12 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  41.07 
 
 
362 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
334 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  35.47 
 
 
357 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  34.19 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  37.19 
 
 
340 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  41.43 
 
 
349 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  42.68 
 
 
335 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  37.92 
 
 
342 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  36.96 
 
 
342 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3785  transport system permease protein  41.2 
 
 
336 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  36.1 
 
 
340 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  31.38 
 
 
336 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  38.51 
 
 
340 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  34.89 
 
 
351 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  40.91 
 
 
363 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  34.89 
 
 
331 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
351 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  34.89 
 
 
331 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
351 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  35.71 
 
 
350 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
351 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  36.22 
 
 
351 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  36.22 
 
 
351 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 
351 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5109  iron-enterobactin transporter membrane protein  36.45 
 
 
335 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.558445  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  39.81 
 
 
344 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
351 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  37.98 
 
 
352 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0330  transport system permease protein  34.15 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4298  transport system permease protein  43.14 
 
 
352 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.000018785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0335  iron compound ABC transporter permease  33.85 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000196235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.25 
 
 
334 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0319  ferrichrome transport system permease  33.85 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793105  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  41.25 
 
 
334 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0350  iron compound ABC transporter permease protein  33.85 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  41.25 
 
 
334 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0134  transport system permease protein  37 
 
 
338 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  36.65 
 
 
333 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0446  iron compound ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 
346 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>