More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0374 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0374  uridylate kinase  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl556  uridine monophosphate kinase  77.64 
 
 
238 aa  380  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.982144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  42.98 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  42.98 
 
 
240 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  45.96 
 
 
245 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  42.55 
 
 
241 aa  194  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  42.98 
 
 
242 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  43.59 
 
 
244 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  42.55 
 
 
241 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  42.55 
 
 
241 aa  192  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  43.56 
 
 
245 aa  192  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  43.64 
 
 
240 aa  190  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  42.92 
 
 
257 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  42.98 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  41.28 
 
 
241 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  42.8 
 
 
240 aa  188  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  43.16 
 
 
249 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  44.07 
 
 
238 aa  186  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  41.85 
 
 
255 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  42.13 
 
 
245 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  43.42 
 
 
245 aa  185  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  40.6 
 
 
240 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  44.84 
 
 
240 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  40.6 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  43.4 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  41.28 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  43.44 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  41.7 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  40.43 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  43.26 
 
 
243 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  41.45 
 
 
243 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  43.56 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  40.6 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  40.6 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  43.44 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  41.03 
 
 
245 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  41.03 
 
 
245 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  41.03 
 
 
245 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  41.03 
 
 
243 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  41.03 
 
 
245 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  44.44 
 
 
237 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  40.77 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  40.17 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  44.02 
 
 
237 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  39.57 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  41.03 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  41.63 
 
 
247 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  40.97 
 
 
238 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  41.03 
 
 
242 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  41.03 
 
 
242 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  41.35 
 
 
242 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  41.03 
 
 
245 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  39.74 
 
 
247 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  41.28 
 
 
247 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  42.13 
 
 
239 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  41.03 
 
 
245 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  41.63 
 
 
240 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  43.59 
 
 
239 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  44 
 
 
241 aa  180  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  41.63 
 
 
240 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  40.17 
 
 
243 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  43.16 
 
 
239 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  41.03 
 
 
242 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  40.6 
 
 
263 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  40.89 
 
 
241 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  43.86 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  40.6 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3515  uridylate kinase  45.54 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459152  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  43.16 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  44.44 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  39.74 
 
 
247 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  40.17 
 
 
248 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  40.6 
 
 
241 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  41.28 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  40.85 
 
 
239 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  40.17 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4268  uridylate kinase  36.32 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0793924  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  41.03 
 
 
243 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  40.17 
 
 
243 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  40.17 
 
 
242 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  44.02 
 
 
239 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  40.85 
 
 
247 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  40.85 
 
 
247 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  40.17 
 
 
245 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  41.77 
 
 
286 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  40.85 
 
 
247 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  39.91 
 
 
241 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  41.6 
 
 
237 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  42.13 
 
 
239 aa  177  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  40.85 
 
 
247 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  39.48 
 
 
257 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  39.74 
 
 
240 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  41.6 
 
 
237 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  42.31 
 
 
240 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  41.6 
 
 
237 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  39.91 
 
 
241 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  41.6 
 
 
237 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  41.95 
 
 
239 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  41.6 
 
 
237 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  40.6 
 
 
241 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>